Miksi NGS on parempi kuin Sanger?
Miksi NGS on parempi kuin Sanger?

Video: Miksi NGS on parempi kuin Sanger?

Video: Miksi NGS on parempi kuin Sanger?
Video: Krista Siegfrids - 6 on parempi kuin 1 (UMK20-finaalin avausnumero) // UMK20 2024, Joulukuu
Anonim

Otoskoko

NGS on huomattavasti halvempi, nopeampi, tarvitsee huomattavasti vähemmän DNA:ta ja on lisää tarkka ja luotettava kuin Sanger jaksotus. Katsotaanpa tätä lisää tarkasti. Varten Sanger sekvensoinnissa tarvitaan suuri määrä templateDNA:ta jokaiseen lukemiseen

Ihmiset kysyvät myös, mitä etuja seuraavan sukupolven sekvensoinnista on?

Jokaisella on tietty etuja kriteereille: lukupituus, tarkkuus, ajoaika ja suorituskyky. DNA-sekvenssien analyysin lisäksi eteneminen jaksotus teknologiat ovat johtaneet muiden biologisten komponenttien, kuten RNA:n ja proteiinin, analysointiin sekä niiden vuorovaikutukseen monimutkaisissa soluverkoissa.

Voidaan myös kysyä, miksi Sanger-sekvensointia käytetään edelleen? Sangerin sekvensointi parantunut vuosien varrella, suurelta osin automaation ansiosta, ja se oli perusta jaksotus ensimmäinen ihmisen genomi vuonna 2000. Alle kahdessa vuosikymmenessä NGS on kuitenkin ohittanut Sangerin sekvensointi korkean suorituskyvyn, rinnakkaistoiminnan ja paljon alhaisempien kustannusten ansiosta.

Näin ollen, mitä eroa on Sanger-sekvensoinnin ja seuraavan sukupolven sekvensoinnin välillä?

Jokainen sisällytetty nukleotidi tunnistetaan sen fluoresoivalla tunnisteella. Kriittinen ero Sanger-sekvenssin välillä ja NGS on jaksotus äänenvoimakkuutta. Samalla kun Sanger vain menetelmä sekvenssejä yksi DNA-fragmentti kerrallaan, NGS on massiivisesti rinnakkainen, jaksotus miljoonia palasia samanaikaisesti ajoa kohden.

Kuinka tarkka Sanger-sekvensointi on?

Sangerin sekvensointi 99,99 % tarkkuus on kliinisen tutkimuksen "kultastandardi". jaksotus . Uudemmat NGS-tekniikat ovat kuitenkin yleistymässä kliinisissä tutkimuslaboratorioissa niiden suuremman suorituskyvyn ja alhaisempien näytekohtaisten kustannusten vuoksi.

Suositeltava: