Kuinka tarkka Sanger-sekvensointi on?
Kuinka tarkka Sanger-sekvensointi on?

Video: Kuinka tarkka Sanger-sekvensointi on?

Video: Kuinka tarkka Sanger-sekvensointi on?
Video: Sanger sequencing 2024, Marraskuu
Anonim

Sangerin sekvensointi 99,99 % tarkkuus on kliinisen tutkimuksen "kultastandardi". jaksotus . Uudemmat NGS-tekniikat ovat kuitenkin yleistymässä myös kliinisissä tutkimuslaboratorioissa niiden suuremman suorituskyvyn ja alhaisempien näytekohtaisten kustannusten vuoksi.

Kysyttiin myös, miksi NGS on parempi kuin Sanger?

Sanger sekvensointi voi sekvensoida vain yhden fragmentin kerrallaan. Koska NGS käyttää virtaussoluja, jotka voivat sitoa miljoonia DNA-kappaleita, NGS voi lukea kaikki nämä sekvenssit samanaikaisesti. Tämä korkean suorituskyvyn ominaisuus tekee siitä erittäin kustannustehokkaan sekvensoitaessa suuria määriä DNA:ta.

Lisäksi, mitä järkeä on Sanger-sekvensoinnissa? Sangerin sekvensointi on prosessi ketjun päättävien dideoksinukleotidien selektiiviseksi sisällyttämiseksi DNA-polymeraasiin in vitro DNA-replikaation aikana; se on laajimmin käytetty menetelmä SNV:iden havaitsemiseen.

Myöhemmin voidaan myös kysyä, mitä eroa on Sanger-sekvensoinnilla ja seuraavan sukupolven sekvensoinnilla?

Seuraava - sukupolven sekvensointi (NGS) tekniikat ovat samanlaisia. Kriittinen ero Sanger-sekvensoinnin välillä ja NGS on jaksotus äänenvoimakkuutta. Samalla kun Sanger vain menetelmä sekvenssejä yksi DNA-fragmentti kerrallaan, NGS on massiivisesti rinnakkainen, jaksotus miljoonia fragmentteja samanaikaisesti ajoa kohden.

Kuinka ketjun päättäminen tapahtuu?

Sangerin DNA jaksotus tunnetaan myös nimellä ketju - irtisanominen menetelmä jaksotus . ddNTP: t johtavat irtisanominen Koska ddNTP:istä puuttuu 3'-OH-ryhmä, jota tarvitaan fosfodiesterisidoksen muodostumiseen nukleotidien välillä. Ilman tätä sidosta ketju muodostuvien nukleotidien määrä on lopetettu.

Suositeltava: